لم يسلم المسجد من حريق موسكو سنة 1812 حيث أتت ألسنة اللهب على هيكله الخشبى ومئذنته، لكن فى العام 1881 سمح القيصر ألكسندر الثانى بإعادة بناء القُبة ومئذنة الجامع ليستعيد مظهره المعتاد، بحسب تقرير لقناة "الغد".

أٌغلق الجامع خلال الحقبة السوفيتية وأزيلت مئذنته وقبته، وتحول إلى مطبعة، وانتظر المسلمون تفكك الاتحاد السوفيتي للعودة إلى الجامع مرة أخرى.