يعانى أهالي محافظة الوادي الجديد، من تغير لون مياه الشرب في بعض الأوقات وتحولها إلى اللون البني والأحمر بصورة ملفتة، وهو ما يتسبب في إثارة مخاوفهم أن المياه ملوثة ولا تصلح للاستخدام الآدمي.

وضعت رئاسة مركز الخارجة خطة عمل إحلال وتطهير لكافة محطات المياه على مستوى المدينة بإجمالي 17 محطة تنقية تم فيها فك كافة أجزاء المحطات وإعادة غسلها بالكامل حيث يتم عملية غسيل أبراج الأكسدة لمحطات المياه من رواسب الحديد أثناء مرور المياه من البئر داخل البرج وغسيل الأواني البلاستيك وإعادتها داخل برج الأكسدة بعد إتمام عملية النظافة من الشوائب.