تضم مكتبة الإسكندرية مجموعة نادرة وقيمة من أمهات الكتب، وخصصت المكتبة، التى تعد أحد أهم الصروح الثقافية بالعالم، قسمًا خاصًا لتلك الكتب، وأطلقت عليه "قسم الكتب النادرة والمجموعات الخاصة"، والذى يحتوى على أقدم وأندر الكتب فى العالم والتى تتميز بقيمة تاريخية كبرى.

وتعود أهمية تلك الكتب إلى أنها طبعت باستخدام وسائل الطباعة الأولى وبعضها كان يتم زخرفته بخط اليد، وهناك بعض الكتب تعود أهميتها لنوعية الورق المستخدم ونوعية "التغليف" الخارجى، مثل مجموعة من الكتب النادرة تم تغليفها بـ"الرق" أى جلد الماعز وكان يستخدم فى القرن الخامس عشر والسادس عشر، وحصلت مكتبة الإسكندرية على تلك الكتب النادرة من خلال تبرعات فردية من أشخاص أو مؤسسات ومكتبات دولية.